Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Top3bQ9Z321 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top3bQ9Z321 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top3bQ9Z321 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms