Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd4Q9Z2D7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mbd4Q9Z2D7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms