Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccne2Q9Z238 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccne2Q9Z238 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms