Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stxbp4Q9WV89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stxbp4Q9WV89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stxbp4Q9WV89 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms