Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnip1Q9WUU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnip1Q9WUU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnip1Q9WUU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms