Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cul1Q9WTX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cul1Q9WTX6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms