Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vax2Q9WTP9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms