Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TapbpQ9R233 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TapbpQ9R233 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TapbpQ9R233 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms