Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubd1Q9R1K7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubd1Q9R1K7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms