Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf7Q9R1C0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf7Q9R1C0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Taf7Q9R1C0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Taf7Q9R1C0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms