Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfwd2Q9R1A8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfwd2Q9R1A8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rfwd2Q9R1A8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms