Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt71Q9R0H5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt71Q9R0H5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt71Q9R0H5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms