Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prkab1Q9R078 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prkab1Q9R078 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prkab1Q9R078 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prkab1Q9R078 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms