Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col4a3Q9QZS0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col4a3Q9QZS0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a3Q9QZS0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a3Q9QZS0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms