Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ripk3Q9QZL0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ripk3Q9QZL0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ripk3Q9QZL0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms