Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ercc4Q9QZD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ercc4Q9QZD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ercc4Q9QZD4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms