Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Exo1Q9QZ11 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Exo1Q9QZ11 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Exo1Q9QZ11 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 484.6 ms