Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cbx8Q9QXV1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cbx8Q9QXV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx8Q9QXV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms