Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcsk1nQ9QXV0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcsk1nQ9QXV0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcsk1nQ9QXV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms