Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt17Q9QWL7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt17Q9QWL7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt17Q9QWL7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms