Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tlr4Q9QUK6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr4Q9QUK6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr4Q9QUK6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms