Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Neu3Q9JMH7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neu3Q9JMH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms