Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arl6ip4Q9JM93 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arl6ip4Q9JM93 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arl6ip4Q9JM93 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arl6ip4Q9JM93 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms