Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arl6ip1Q9JKW0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Arl6ip1Q9JKW0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms