Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ybx3Q9JKB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ybx3Q9JKB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ybx3Q9JKB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ybx3Q9JKB3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms