Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cog8Q9JJA2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cog8Q9JJA2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cog8Q9JJA2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms