Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpf2Q9JJ80 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpf2Q9JJ80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf2Q9JJ80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpf2Q9JJ80 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpf2Q9JJ80 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpf2Q9JJ80 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms