Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nup50Q9JIH2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nup50Q9JIH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms