Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc15Q9JHS9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc15Q9JHS9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms