Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RabggtaQ9JHK4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RabggtaQ9JHK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RabggtaQ9JHK4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
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