Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Rb1cc1Q9ESK9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
Rb1cc1Q9ESK9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms