Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ube3bQ9ES34 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ube3bQ9ES34 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms