Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenofQ9ERR7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenofQ9ERR7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms