Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sall1Q9ER74 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sall1Q9ER74 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sall1Q9ER74 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms