Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col4a3bpQ9EQG9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col4a3bpQ9EQG9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col4a3bpQ9EQG9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms