Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ap3s1Q9DCR2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ap3s1Q9DCR2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ap3s1Q9DCR2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms