Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ergic1Q9DC16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ergic1Q9DC16 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ergic1Q9DC16 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms