Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtr1Q9DBC3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtr1Q9DBC3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms