Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelenooQ9DBC0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SelenooQ9DBC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SelenooQ9DBC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms