Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smim23Q9DAL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smim23Q9DAL0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smim23Q9DAL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms