Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc89Q9DA73 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc89Q9DA73 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc89Q9DA73 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms