Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q9D9H8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9D9H8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q9D9H8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9D9H8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Q9D9H8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Q9D9H8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q9D9H8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q9D9H8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q9D9H8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q9D9H8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms