Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D8Q6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9D8Q6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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