Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lin37Q9D8N6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lin37Q9D8N6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms