Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ifi35Q9D8C4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi35Q9D8C4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi35Q9D8C4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms