Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jam3Q9D8B7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jam3Q9D8B7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms