Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc4Q9D844 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc4Q9D844 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc4Q9D844 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dnajc4Q9D844 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dnajc4Q9D844 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms