Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tspan17Q9D7W4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tspan17Q9D7W4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tspan17Q9D7W4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms