Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capns2Q9D7J7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capns2Q9D7J7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capns2Q9D7J7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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