Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Srp19Q9D7A6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srp19Q9D7A6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms